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   “目前较为成熟的系统已经实现了活细胞内绝大部分重复DNA序列成像和多色成像,甚至在一定程度上实现了非重复DNA序列成像,但它们都存在明显的局限性。”杨良中举例说,比如一些系统,通过改进向导RNA表达质粒的构建方式,将多条向导RNA表达元件放到同一个质粒上,从而减少需要向细胞内递送质粒的数目,增强成像效果。但将多个表达元件构建到一个质粒的方法步骤繁多、操作复杂,并不利于推广使用。还有一些系统,通过将DNA的标记信号放大,实现一条向导RNA对目的序列的标记和成像。但仅利用一条向导RNA可能会存在标记脱靶的问题。

   “我们开发的新型DNA成像系统CRISPRdelight正是利用了这一特点,通过表达一条能编码多条向导RNA的转录本(即CRISPR阵列)来进行成像,而非单独转录每条向导RNA。”杨良中介绍,这样既实现了对靶点DNA信号的富集放大,又避免了系统复杂度增加。而且这一条转录本不仅可以编码靶向同一DNA位点的向导RNA,也可以同时编码靶向不同位点的向导RNA,实现多位点多色成像。因此,新系统更加简便高效,容易通过增加向导RNA的数目提高成像质量,大大降低了活细胞中非重复序列DNA成像的门槛。

   日前,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员陈玲玲团队开发了一种活细胞DNA成像新工具。团队筛选并优化了现有的基因编辑系统CRISPR-dCas12a,并基于此构建了新型DNA成像系统CRISPRdelight。这一新工具可用于活细胞内非重复DNA序列成像,为研究活细胞中DNA位点的空间位置和动力学特征提供了更加简单便利的手段。相关研究论文在线发表于《自然・方法》杂志。

   与此同时,团队利用新系统揭示了基因位点在细胞核内的定位与其运动能力和转录活性的相关性,还实现了对4种活细胞内卫星DNA的多位点多色成像。

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【编辑:吴立功】

发布于:永吉县
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