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   “目前较为成熟的系统已经实现了活细胞内绝大部分重复DNA序列成像和多色成像,甚至在一定程度上实现了非重复DNA序列成像,但它们都存在明显的局限性。”杨良中举例说,比如一些系统,通过改进向导RNA表达质粒的构建方式,将多条向导RNA表达元件放到同一个质粒上,从而减少需要向细胞内递送质粒的数目,增强成像效果。但将多个表达元件构建到一个质粒的方法步骤繁多、操作复杂,并不利于推广使用。还有一些系统,通过将DNA的标记信号放大,实现一条向导RNA对目的序列的标记和成像。但仅利用一条向导RNA可能会存在标记脱靶的问题。

   非重复DNA序列成像和多位点多色成像是活细胞DNA成像长期面临的两大难题。如今,新系统的出现基本解决了非重复DNA序列成像的问题,但在活细胞DNA多位点多色成像方面,新系统仍有改进空间。“尽管我们通过在新系统中引入RNA适配体实现了多个重复DNA序列的多位点多色成像,但是RNA适配体的引入在一定程度上影响了系统对CRISPR阵列的加工能力。”杨良中说,要实现多个非重复DNA序列的标记追踪,未来还需进一步对CRISPRdelight进行优化。

   “当前,活细胞DNA成像工具的种类已经十分丰富。”论文第一作者、中国科学院分子细胞科学卓越创新中心博士杨良中介绍,其中大部分工具都是从CRISPR/dCas9-EGFP(EGPF是一种荧光蛋白质)系统衍生而来。这些已有的活细胞DNA成像工具分别从向导RNA的骨架结构和表达质粒构建方式等方面,对原始系统进行优化升级。

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